Việc giải thể chi nhánh công ty cổ phần thường gây áp lực cho doanh nghiệp vì liên quan đến nghĩa vụ thuế, hợp đồng và trách nhiệm với người lao động. Nếu xử lý sai quy trình hoặc thiếu hồ sơ, doanh nghiệp dễ gặp rủi ro phạt chậm, nợ thuế hoặc kéo dài thời gian đóng mã số thuế. Bài viết này hướng dẫn đầy đủ hồ sơ, thủ tục và quy trình giải thể chi nhánh công ty cổ phần hạch toán phụ thuộc/độc lập theo quy định mới 2026, kèm các lưu ý quan trọng giúp doanh nghiệp thực hiện nhanh – đúng – tránh sai sót.
1. Căn cứ pháp lý
- Luật Doanh nghiệp 2020, có hiệu lực từ ngày 01/01/2021.
- Luật Doanh nghiệp sửa đổi 2025, có hiệu lực từ ngày 01/07/2025.
- Nghị định 168/2025/NĐ-CP, có hiệu lực từ ngày 01/07/2025.
- Thông tư 86/2024/TT-BTC, có hiệu lực từ ngày 06/02/2025.
- Thông tư số 68/2025/TT-BTC, có hiệu lực từ ngày 01/07/2025.
- Nghị định 122/2021/NĐ-CP, có hiệu lực từ ngày 01/01/2022.
2. Phân loại các loại chi nhánh công ty cổ phần
Khi thành lập chi nhánh, công ty cổ phần cần lựa chọn hình thức hạch toán phù hợp với mô hình và chiến lược kinh doanh. Dựa trên cách thức tổ chức kế toán, chi nhánh được chia thành hai loại chính là chi nhánh hạch toán độc lập và chi nhánh hạch toán phụ thuộc. Mỗi loại có những đặc điểm riêng về nghĩa vụ thuế, quyền phát hành hóa đơn, và cách quản lý tài chính – kế toán.
| Tiêu chí | Chế độ hạch toán độc lập |
Chế độ hạch toán phụ thuộc |
| Chữ ký số | Bắt buộc | Không bắt buộc |
| Tài khoản ngân hàng | Bắt buộc | Không bắt buộc |
| Kê khai thuế, báo cáo tài chính | Độc lập | Do công ty mẹ thực hiện |
| Các loại tờ khai thuế, báo cáo của chi nhánh |
|
|
Khi làm thủ tục giải thể, chi nhánh hạch toán độc lập phải tự thực hiện đầy đủ các bước trong thủ tục giải thể (trừ việc xóa chữ ký số). Trong khi đó, chi nhánh hạch toán phụ thuộc:
|
Hạng mục |
Khác tỉnh/thành phố với trụ sở chính |
Cùng tỉnh/thành phố với trụ sở chính |
|
Nghĩa vụ thuế |
Phụ thuộc vào công ty chủ quản để hoàn thành các nghĩa vụ thuế |
Phụ thuộc vào công ty chủ quản để hoàn thành các nghĩa vụ thuế |
|
Con dấu |
Nếu là con dấu do Công an cấp, cần làm thủ tục trả lại con dấu |
Nếu có con dấu riêng và con dấu đó do Công an cấp, cần làm thủ tục trả lại con dấu |
|
Hóa đơn |
Nếu có phát hành hóa đơn riêng thì chi nhánh cần tự làm thủ tục hủy hóa đơn, nếu không thì không cần làm thủ tục hủy hóa đơn |
Nếu có phát hành hóa đơn riêng thì chi nhánh cần tự làm thủ tục hủy hóa đơn, nếu không thì không cần làm thủ tục hủy hóa đơn |
|
Chữ ký số |
Công ty liên hệ với nhà cung cấp dịch vụ chữ ký số để được hỗ trợ xóa chữ ký số |
Nếu có chữ ký số, công ty liên hệ với nhà cung cấp dịch vụ chữ ký số để được hỗ trợ xóa chữ ký số |

3. Điều kiện đóng cửa chi nhánh phụ thuộc/độc lập
Ngoài thủ tục giải thể, các chi nhánh vẫn cần hoàn tất báo cáo và quyết toán thuế trước khi chấm dứt hoạt động. Với dịch vụ kế toán thuế trọn gói của Kế toán MK, doanh nghiệp sẽ được hỗ trợ toàn diện từ lập báo cáo, kiểm tra số liệu đến hoàn tất nghĩa vụ thuế với cơ quan chức năng, kèm biểu phí dịch vụ kế toán minh bạch để chủ động dự toán chi phí ngay từ đầu. Cụ thể, công ty cần tuân thủ đúng và đầy đủ các điều kiện theo quy định để quá trình giải thể diễn ra hợp pháp, tránh phát sinh tranh chấp hoặc trách nhiệm pháp lý sau này:
Hoàn thành nghĩa vụ thuế: Theo khoản 1 Điều 72 Nghị định 01/2021/NĐ-CP, trước khi gửi thông báo giải thể chi nhánh đến Phòng Đăng ký kinh doanh, công ty cần rà soát và xác nhận tình trạng nợ thuế, bao gồm:
- Thuế giá trị gia tăng (VAT).
- Thuế thu nhập doanh nghiệp (đối với chi nhánh hạch toán độc lập).
- Lệ phí môn bài và các loại thuế, phí khác (nếu có).
Thanh toán các khoản nợ và nghĩa vụ hợp đồng: Theo Điều 213 Luật Doanh nghiệp 2020, công ty chủ quản có trách nhiệm thanh toán tất cả các khoản nợ của chi nhánh trước khi tiến hành thủ tục giải thể. Các khoản nợ này bao gồm:
- Nợ thuế và phí phát sinh tại chi nhánh.
- Nợ đối tác, khách hàng, nhà cung cấp theo hợp đồng kinh tế còn hiệu lực.
- Các nghĩa vụ với người lao động, bao gồm tiền lương, trợ cấp thôi việc, bảo hiểm xã hội và các quyền lợi hợp pháp khác.
Trong quá trình cơ cấu lại hoạt động, nhiều doanh nghiệp TNHH 1 thành viên cũng tiến hành giải thể chi nhánh hoặc chấm dứt toàn bộ công ty khi không còn nhu cầu kinh doanh. Nếu bạn đang ở tình huống tương tự, có thể tham khảo hướng dẫn chi tiết về giải thể công ty TNHH 1 thành viên để nắm rõ điều kiện và quy trình thực hiện đúng luật.

4. Quy trình giải thể chi nhánh phụ thuộc/ độc lập với từng trường hợp
Tùy từng trường hợp cụ thể, khách hàng cần thực hiện đúng thủ tục, quy trình tương ứng theo quy định của pháp luật hiện hành.
4.1. Trường hợp công ty quyết định chấm dứt hoạt động chi nhánh
Khi chủ động quyết định dừng hoạt động chi nhánh, công ty cần thực hiện đầy đủ các thủ tục giải thể chi nhánh phụ thuộc với cơ quan thuế và cơ quan đăng ký kinh doanh để đảm bảo việc giải thể diễn ra hợp pháp và thuận lợi. Thủ tục bao gồm hai bước:
- Bước 1: Công ty phải đăng ký với cơ quan thuế để hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế, đồng thời nộp văn bản đề nghị chấm dứt mã số thuế theo quy định.
- Bước 2: Trong vòng 10 ngày làm việc kể từ ngày có quyết định chấm dứt hoạt động, công ty phải nộp hồ sơ thông báo chấm dứt hoạt động chi nhánh đến Phòng Đăng ký kinh doanh nơi chi nhánh đặt trụ sở. Nếu hồ sơ hợp lệ và cơ quan thuế xác nhận chi nhánh đã hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế, Phòng Đăng ký kinh doanh sẽ xét duyệt quyết định giải thể trong thời hạn 05 ngày làm việc.
|
Lưu ý: Trường hợp chấm dứt hoạt động chi nhánh ở nước ngoài, công ty thực hiện theo pháp luật nước sở tại. Trong 30 ngày kể từ ngày chính thức giải thể chi nhánh, công ty phải gửi Thông báo theo Mẫu Phụ lục II-21 (Thông tư 01/2021/TT-BKHĐT) đến Phòng Đăng ký kinh doanh nơi đặt trụ sở chính. Phòng đăng ký kinh doanh sẽ cập nhật thông tin trong 03 ngày làm việc kể từ khi nhận được thông báo. |
Tải Mẫu Phụ lục II-21 cập nhật mới nhất!

4.2. Trường hợp chi nhánh bị chấm dứt hoạt động do bị thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký hoạt động
Trong trường hợp chi nhánh bị thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký hoạt động (ngoại trừ trường hợp bị thu hồi do cưỡng chế nợ thuế), công ty có trách nhiệm thực hiện thủ tục chấm dứt hoạt động cho chi nhánh trong thời hạn 15 ngày kể từ ngày có quyết định thu hồi. Ngoài ra, công ty mẹ vẫn phải đảm bảo thực hiện đầy đủ các hợp đồng, thanh toán tất cả các khoản nợ, kể cả nợ thuế liên quan đến chi nhánh.
Trong thực tế, nhiều doanh nghiệp có chi nhánh hoạt động theo mô hình công ty cổ phần. Khi muốn chấm dứt hoạt động, chủ doanh nghiệp cần nắm rõ quy định không chỉ với chi nhánh mà cả ở cấp công ty mẹ. Bạn có thể tìm hiểu chi tiết hơn về thủ tục giải thể công ty cổ phần để đảm bảo quy trình diễn ra đúng pháp luật và tránh rủi ro liên đới.

Trong quá trình giải thể chi nhánh, doanh nghiệp phải thực hiện nhiều thủ tục liên quan đến pháp lý, thuế và công nợ. Để tránh sai sót và tiết kiệm thời gian, lựa chọn dịch vụ giải thể doanh nghiệp của Kế toán MK sẽ giúp doanh nghiệp thực hiện trình tự giải thể công ty TNHH và chi nhánh một cách nhanh chóng, chính xác và đúng quy định pháp luật.
5. Thủ tục, hồ sơ giải thể (đóng cửa) chi nhánh hạch toán phụ thuộc/độc lập
Khi giải thể chi nhánh, doanh nghiệp cần chuẩn bị hai bộ hồ sơ riêng biệt: hồ sơ chấm dứt mã số thuế và hồ sơ chấm dứt hoạt động chi nhánh. Trong đó, hồ sơ thuế cần hoàn tất trước để bảo đảm chi nhánh không còn nghĩa vụ tài chính trước khi bị xóa khỏi Hệ thống thông tin Đăng ký doanh nghiệp quốc gia.
Hồ sơ chấm dứt mã số thuế (nộp tại Chi cục Thuế nơi chi nhánh đặt trụ sở), gồm:
- Văn bản đề nghị chấm dứt hiệu lực mã số thuế (theo Mẫu 24/ĐK-TCT ban hành kèm Thông tư 86/2024/TT-BTC).
- Bản gốc Giấy chứng nhận đăng ký thuế (hoặc công văn giải trình nếu bị mất).
- Bản sao quyết định hoặc thông báo giải thể chi nhánh của doanh nghiệp chủ quản.
- Giấy xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế xuất nhập khẩu do Tổng cục Hải quan cấp (nếu có liên quan).
- Công văn xác nhận không nợ thuế (nếu có yêu cầu từ cơ quan thuế).
- Giấy ủy quyền (nếu người khác thực hiện thủ tục).

Hồ sơ chấm dứt hoạt động chi nhánh (nộp tại Cơ quan Đăng ký kinh doanh), gồm:
- Thông báo về việc chấm dứt hoạt động chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh theo mẫu Phụ lục I-65 (ban hành kèm theo Thông tư 68/2025/TT-BTC) (bản chính);
- Nghị quyết, quyết định của chủ sở hữu công ty đối với công ty TNHH một thành viên, doanh nghiệp tư nhân, của Hội đồng thành viên đối với công ty TNHH hai thành viên trở lên và biên bản họp Hội đồng thành viên, của Đại hội đồng cổ đông và biên bản họp đối với công ty cổ phần về việc chấm dứt hoạt động chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh;
- Hồ sơ giải thể địa điểm kinh doanh chỉ cần nộp thông báo về việc chấm dứt hoạt động địa điểm kinh doanh theo Mẫu Phụ lục I-65 (ban hành kèm theo Thông tư 68/2025/TT-BTC) (bản chính);
- Giấy ủy quyền và giấy tờ tùy thân (CMND/CCCD/Hộ chiếu) của người thực hiện thủ tục thay doanh nghiệp.
Đối với những cơ sở hoạt động độc lập dưới hình thức hộ kinh doanh, hồ sơ giải thể sẽ có sự khác biệt so với doanh nghiệp hoặc chi nhánh. Nếu bạn đang trong trường hợp này, hãy tham khảo thêm hồ sơ giải thể hộ kinh doanh để biết cần chuẩn bị giấy tờ gì và thực hiện theo đúng quy trình pháp lý.
6. Lưu ý khi chấm dứt hoạt động của chi nhánh
Trong quá trình thực hiện thủ tục giải thể chi nhánh công ty cổ phần hay thủ tục giải thể công ty TNHH một thành viên, doanh nghiệp cần lưu ý một số điểm quan trọng để tránh sai sót hoặc kéo dài thời gian xử lý hồ sơ.
- Hủy hóa đơn điện tử: Nếu chi nhánh có sử dụng hóa đơn điện tử, doanh nghiệp phải làm thủ tục hủy toàn bộ hóa đơn chưa sử dụng theo quy định trước khi nộp hồ sơ giải thể.
- Trả con dấu: Đối với chi nhánh hạch toán độc lập được thành lập và hoạt động trước ngày 01/7/2015, cần làm thêm thủ tục trả con dấu cho cơ quan Công an quản lý.
- Xóa chữ ký số: Doanh nghiệp nên liên hệ với nhà cung cấp dịch vụ chữ ký số để được hỗ trợ xóa chữ ký số cho chi nhánh hạch toán độc lập trước khi tiến hành giải thể.
Nếu doanh nghiệp gặp khó khăn trong quá trình làm thủ tục giải thể chi nhánh, hãy liên hệ Kế toán MK qua số 0909 526 598 (Mrs. Thương) để được tư vấn và hỗ trợ toàn diện. Khi sử dụng dịch vụ tại Kế toán MK, doanh nghiệp nhận được nhiều lợi ích vượt trội:
- Chi phí minh bạch: Kế toán MK cam kết báo giá rõ ràng ngay từ đầu, không phát sinh chi phí ẩn, giúp doanh nghiệp dễ dàng dự trù ngân sách và yên tâm sử dụng dịch vụ. Với các doanh nghiệp nhỏ, việc thuê nhân sự kế toán riêng đôi khi gây tốn kém. Chính vì vậy, giải pháp tối ưu chính là lựa chọn dịch vụ kế toán giá rẻ của Kế toán MK vừa giúp tiết kiệm chi phí vừa đảm bảo số liệu kế toán – thuế minh bạch, chính xác theo quy định của pháp luật.
- Đội ngũ chuyên viên giàu kinh nghiệm: Với nhiều năm kinh nghiệm trong lĩnh vực kế toán, thuế và pháp lý doanh nghiệp, đội ngũ của Kế toán MK am hiểu quy định và có khả năng xử lý linh hoạt các tình huống thực tế.
- Giải pháp cá nhân hóa: Mỗi doanh nghiệp có đặc thù riêng, vì vậy Kế toán MK luôn đưa ra phương án tối ưu, phù hợp với quy mô và nhu cầu cụ thể của từng khách hàng, đảm bảo hiệu quả và tiết kiệm thời gian.
7. Một số câu hỏi về thủ tục giải thể chi nhánh
Thủ tục giải thể chi nhánh tuy không quá phức tạp, nhưng vẫn có thể phát sinh nhiều vướng mắc nếu doanh nghiệp chưa nắm rõ quy định pháp luật. Dưới đây là những câu hỏi và lời đáp thường gặp giúp bạn chủ động xử lý các tình huống phát sinh trong quá trình thực hiện.
7.1. Chi nhánh có thể bị giải thể trong những trường hợp nào?
Theo khoản 1 Điều 213 Luật Doanh nghiệp 2020, sửa đổi bởi khoản 24 Điều 1 Luật doanh nghiệp sửa đổi 2025, chi nhánh công ty có thể bị giải thể trong hai trường hợp:
Theo quyết định của chính doanh nghiệp: Doanh nghiệp chủ động chấm dứt hoạt động chi nhánh vì lý do cơ cấu, thay đổi chiến lược hoặc không còn nhu cầu duy trì.
Theo quyết định thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp, hoạt động chi nhánh: Căn cứ Điều 71 Nghị định 168/2025/NĐ-CP, chi nhánh sẽ bị thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký hoạt động nếu bị phát hiện sử dụng hồ sơ giả mạo trong quá trình đăng ký; đã ngừng hoạt động liên tục từ 01 năm trở lên mà không thông báo với cơ quan đăng ký kinh doanh; bị Tòa án tuyên bố chấm dứt hoặc có đề nghị từ cơ quan nhà nước có thẩm quyền.

7.2. Trường hợp nào phải trả dấu chi nhánh cho công an?
Nếu chi nhánh được thành lập trước ngày 01/7/2015 – thời điểm chưa áp dụng cơ chế tự chủ về mẫu dấu theo Luật Doanh nghiệp, khi giải thể, chi nhánh phải nộp lại con dấu và Giấy chứng nhận đăng ký mẫu dấu cho cơ quan công an theo quy định tại khoản 8 Điều 64 Nghị định 168/2025/NĐ-CP.
7.3. Điều kiện để được giải thể chi nhánh hợp pháp là gì?
Chi nhánh chỉ được giải thể khi đáp ứng các điều kiện sau:
- Hoàn thành thanh toán các khoản nợ và các nghĩa vụ tài chính khác.
- Không trong các tranh chấp đang được giải quyết tại Tòa án hoặc các cơ quan trọng tài.
Giải thể chi nhánh công ty cổ phần hạch toán phụ thuộc hay độc lập là một thủ tục pháp lý phức tạp, đòi hỏi doanh nghiệp phải tuân thủ đầy đủ quy định về hồ sơ, nghĩa vụ thuế và thời hạn theo luật định để tránh rủi ro phát sinh. Để đảm bảo thủ tục diễn ra nhanh gọn, chính xác và tuân thủ pháp luật, khách hàng có thể ký hợp đồng với các công ty cung cấp dịch vụ kế toán chuyên nghiệp. Kế Toán MK chuyên cung cấp dịch vụ giải thể công ty, giúp doanh nghiệp thực hiện trình tự giải thể công ty TNHH, trình tự giải thể công ty cổ phần và chi nhánh với quy trình xin giải thể công ty TNHH nhanh chóng, hiệu quả và đúng quy định pháp luật.
Kế toán MK cung cấp dịch vụ thành lập, giải thể doanh nghiệp và kế toán – thuế trọn gói, đồng hành cùng sự phát triển bền vững của hộ kinh doanh và doanh nghiệp vừa, nhỏ:
Trụ sở chính Hồ Chí Minh:
- Địa chỉ: 652/31B Quốc lộ 13, Phường Hiệp Bình, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam.
- Mã số thuế: 0317916553
Văn phòng đại diện Hồng Ngự, Đồng Tháp:
- Địa chỉ: 120 Xuân Diệu, Phường Hồng Ngự, Tỉnh Đồng Tháp, Việt Nam.
- Mã số thuế: 0317916553-001
Thông tin liên hệ:
- Dịch vụ pháp lý: 0909 526 598 (Mrs. Thương)
- Dịch vụ kế toán: 0915 101 726 (Mrs. Thảo) | 0908 847 986 (Mr. Nhân)
- Email: info@ketoanmk.com
- Website: www.ketoanmk.com
Thời gian làm việc:
- Thứ 2 – Thứ 6: 8:00 AM – 5:30 PM
- Thứ 7: 8:00 AM – 4:30 PM
