Kiểm tra thuế khi giải thể doanh nghiệp là quá trình cơ quan thuế rà soát, đối chiếu và xác nhận việc doanh nghiệp đã hoàn thành toàn bộ nghĩa vụ với ngân sách nhà nước. Vậy cụ thể quá trình này diễn ra như thế nào, có những trường hợp nào được miễn kiểm tra và doanh nghiệp cần chuẩn bị gì? Hãy cùng Kế toán MK tìm hiểu trong bài viết dưới đây!
1. Kiểm tra thuế bao gồm những hoạt động gì?
Khi doanh nghiệp tiến hành giải thể, cơ quan thuế sẽ thực hiện kiểm tra toàn bộ tình hình kê khai, nộp và quyết toán các khoản thuế phát sinh trong suốt quá trình hoạt động. Các loại thuế thường được rà soát bao gồm: thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN), thuế giá trị gia tăng (GTGT), thuế thu nhập cá nhân (TNCN) của người lao động, cùng những loại thuế, phí liên quan khác.
Trong quá trình kiểm tra, cơ quan thuế sẽ xem xét các hạng mục:
- Hồ sơ kế toán, báo cáo tài chính và tờ khai quyết toán thuế của doanh nghiệp.
- Hóa đơn, chứng từ và các tài liệu phát sinh từ hoạt động kinh doanh.

Trường hợp cơ quan thuế phát hiện doanh nghiệp có sai sót hoặc có dấu hiệu vi phạm, doanh nghiệp sẽ cần điều chỉnh hồ sơ, nộp bổ sung thuế hoặc chịu xử phạt hành chính tương ứng theo quy định pháp luật. Vì vậy, việc chuẩn bị hồ sơ kế toán rõ ràng, đối chiếu số liệu cẩn thận và đảm bảo tính chính xác sẽ giúp doanh nghiệp rút ngắn thời gian kiểm tra và hoàn tất thủ tục giải thể suôn sẻ.
2. Trường hợp không bị kiểm tra thuế khi giải thể doanh nghiệp
Theo Điều 110 Luật Quản lý thuế năm 2019, hướng dẫn tại khoản 1 Điều 72 Thông tư 80/2021/TT-BTC cơ quan thuế sẽ không thực hiện kiểm tra trong các trường hợp sau:
- Doanh nghiệp nộp thuế thu nhập doanh nghiệp theo tỷ lệ % trên doanh thu bán hàng hóa, dịch vụ theo quy định của pháp luật về thuế TNDN và đang tiến hành giải thể, chấm dứt hoạt động.
- Doanh nghiệp giải thể nhưng chưa phát sinh doanh thu, chưa sử dụng hóa đơn kể từ thời điểm thành lập đến khi chấm dứt hoạt động.

3. Doanh nghiệp giải thể cần làm gì khi kiểm tra thuế?
Doanh nghiệp cần thực hiện đúng, đầy đủ các bước sau đây để quá trình kiểm tra thuế diễn ra nhanh chóng, thuận lợi:
Bước 1: Gửi thông báo giải thể đến cơ quan thuế
Trong thời hạn 45 ngày kể từ khi thông qua quyết định giải thể, doanh nghiệp phải gửi thông báo giải thể đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp theo quy định tại Điều 59 Luật Doanh nghiệp 2020 và khoản 1 Điều 4 Nghị định 126/2020/NĐ-CP.
Hồ sơ thông báo cần đính kèm:
- Quyết định giải thể.
- Thông báo giải thể.
- Báo cáo tình hình sử dụng hóa đơn (mẫu số BC26/HĐG ban hành kèm theo Nghị định 123/2020/NĐ-CP).
Việc gửi thông báo đúng thời hạn giúp cơ quan thuế bắt đầu quá trình rà soát, tránh phát sinh nợ thuế hoặc vi phạm hành chính do chậm thông báo.

Bước 2: Chuẩn bị hồ sơ kiểm tra thuế đầy đủ
Theo quy định tại Điều 38 Luật Kế toán 2015, doanh nghiệp phải lưu trữ đầy đủ các tài liệu kế toán và hồ sơ thuế trong tối thiểu 10 năm. Khi tiến hành giải thể, bộ hồ sơ kiểm tra thuế cần bao gồm:
- Tờ khai quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp và các loại thuế phát sinh khác.
- Báo cáo tài chính, sổ sách kế toán, hóa đơn, chứng từ thuế.
- Các báo cáo chuyên biệt tùy theo từng loại hình kinh doanh hoặc nghĩa vụ thuế.
Doanh nghiệp nên rà soát kỹ để bảo đảm số liệu chính xác, thống nhất. Trường hợp sai sót hoặc kê khai thiếu, cơ quan thuế có quyền yêu cầu bổ sung và xử phạt theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP.

Bước 3: Làm việc trực tiếp với cơ quan thuế
Sau khi tiếp nhận hồ sơ giải thể, cơ quan thuế sẽ tiến hành kiểm tra tại trụ sở doanh nghiệp hoặc qua hệ thống điện tử, căn cứ khoản 3 Điều 6 Nghị định 126/2020/NĐ-CP.
Nội dung kiểm tra bao gồm:
- Đối chiếu tờ khai và báo cáo thuế.
- Kiểm tra tình trạng nộp thuế, các khoản còn tồn đọng.
- Xác minh tính hợp pháp của hóa đơn, chứng từ.
Doanh nghiệp cần cử người đại diện hợp pháp làm việc với đoàn kiểm tra, sẵn sàng giải trình hoặc cung cấp tài liệu bổ sung khi được yêu cầu. Theo Thông tư 105/2020/TT-BTC, cơ quan thuế sẽ ban hành biên bản kiểm tra hoặc kết luận trong vòng 5 ngày làm việc nếu kiểm tra tại chỗ, hoặc 7 ngày làm việc đối với hồ sơ được xử lý trực tuyến.

Bước 4: Xử lý các khoản nợ thuế và sai sót (nếu có)
Trong trường hợp cơ quan thuế phát hiện doanh nghiệp còn nợ thuế hoặc có sai sót trong kê khai, doanh nghiệp phải nộp bổ sung đầy đủ các khoản còn thiếu, bao gồm:
- Thuế giá trị gia tăng (GTGT).
- Thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN).
- Các khoản xử phạt hành chính (nếu có vi phạm).
Tất cả nghĩa vụ này cần được hoàn tất trước khi cơ quan thuế cấp giấy xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế, theo Điều 55 Luật Quản lý thuế 2019. Trường hợp doanh nghiệp không đồng ý với kết luận kiểm tra, doanh nghiệp có thể nộp đơn khiếu nại theo Điều 61 Luật Quản lý thuế 2019.
Bước 5: Nhận giấy xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế
Sau khi doanh nghiệp hoàn tất toàn bộ nghĩa vụ tài chính, cơ quan thuế sẽ cấp văn bản xác nhận hoàn thành nghĩa vụ thuế. Giấy xác nhận này là điều kiện bắt buộc để doanh nghiệp được nộp hồ sơ giải thể tại cơ quan đăng ký kinh doanh, căn cứ Điều 59 Luật Doanh nghiệp 2020. Doanh nghiệp nên chủ động theo dõi tiến độ xử lý và phối hợp với cơ quan thuế để tránh kéo dài thời gian xác nhận do sai sót hoặc hồ sơ chưa đầy đủ.

4. Lưu ý khi kiểm tra thuế trong quá trình làm thủ tục giải thể
Trước khi tiến hành giải thể, doanh nghiệp cần chuẩn bị đầy đủ hồ sơ và rà soát kỹ các nghĩa vụ thuế để quá trình kiểm tra diễn ra thuận lợi. Một số lưu ý quan trọng bao gồm:
- Rà soát nghĩa vụ thuế: Doanh nghiệp cần kiểm tra toàn bộ các loại thuế còn tồn đọng như thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế giá trị gia tăng, thuế thu nhập cá nhân và các khoản phí khác. Việc rà soát kỹ lưỡng giúp phát hiện sai sót sớm, tránh bị truy thu hoặc xử phạt.
- Rà soát các khoản nợ: Trước khi gửi đề nghị kiểm tra, doanh nghiệp nên thanh toán toàn bộ các khoản nợ với đối tác, nhà cung cấp, người lao động và các nghĩa vụ tài chính khác. Mục đích của việc rà soát các khoản nợ là để hạn chế rủi ro phát sinh tranh chấp trong quá trình giải thể, cũng như chứng minh sự minh bạch trong tình hình tài chính của doanh nghiệp.
- Gửi văn bản đề nghị kiểm tra thuế: Sau khi hoàn tất việc rà soát nội bộ, doanh nghiệp cần lập công văn đề nghị kiểm tra thuế gửi đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp. Trong công văn, doanh nghiệp cần ghi rõ thông tin doanh nghiệp, mã số thuế, lý do giải thể và thời điểm dự kiến chấm dứt hoạt động để cơ quan thuế sắp xếp lịch kiểm tra phù hợp.
- Thực hiện thủ tục đóng mã số thuế: Khi đã hoàn tất việc kiểm tra, doanh nghiệp nộp Tờ khai đề nghị đóng mã số thuế (mẫu 24/ĐK-TCT) theo quy định của cơ quan thuế. Sau khi mã số thuế được đóng, doanh nghiệp chính thức chấm dứt nghĩa vụ tài chính với Nhà nước và có thể tiếp tục các bước giải thể tại cơ quan đăng ký kinh doanh.

Kiểm tra thuế khi giải thể doanh nghiệp là bước quan trọng để đảm bảo doanh nghiệp đã hoàn tất đầy đủ nghĩa vụ với Nhà nước trước khi chính thức chấm dứt hoạt động. Việc chủ động chuẩn bị hồ sơ, rà soát kỹ các khoản thuế và hợp tác chặt chẽ với cơ quan thuế sẽ giúp quá trình diễn ra nhanh gọn và đúng quy định pháp luật. Nếu bạn đang cần hỗ trợ trong việc giải thể công ty trọn gói, hãy liên hệ với Kế toán MK để được tư vấn chi tiết!
Kế toán MK cung cấp dịch vụ thành lập, giải thể doanh nghiệp và kế toán – thuế trọn gói, đồng hành cùng sự phát triển bền vững của hộ kinh doanh và doanh nghiệp vừa, nhỏ:
Trụ sở chính Hồ Chí Minh:
- Địa chỉ: 652/31B Quốc lộ 13, Phường Hiệp Bình, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam.
- Mã số thuế: 0317916553
Văn phòng đại diện Hồng Ngự, Đồng Tháp:
- Địa chỉ: 120 Xuân Diệu, Phường Hồng Ngự, Tỉnh Đồng Tháp, Việt Nam.
- Mã số thuế: 0317916553-001
Thông tin liên hệ:
- Dịch vụ pháp lý: 0909 526 598 (Mrs. Thương)
- Dịch vụ kế toán: 0915 101 726 (Mrs. Thảo) | 0908 847 986 (Mr. Nhân)
- Email: info@ketoanmk.com
- Website: www.ketoanmk.com
Thời gian làm việc:
- Thứ 2 – Thứ 6: 8:00 AM – 5:30 PM
- Thứ 7: 8:00 AM – 4:30 PM



